Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A087X0B3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A087X0B3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0B3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A087X0B3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms