Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
V9GYS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
V9GYS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms