Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHAC2Q9Y5I4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms