Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC55.13■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.13■■■■■ 6.42
NISCHQ9Y2I1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.12■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC55.12■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.12■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC55.12■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.12■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC55.11■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC55.11■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.11■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC55.1■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC55.09■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.08■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC55.08■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC55.07■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
NISCHQ9Y2I1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC55.06■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.03■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC55.03■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC55.03■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.02■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC55.02■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC55.02■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.02■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC55■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC55■■■■■ 6.4
NISCHQ9Y2I1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC55■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC55■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC54.99■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC54.99■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.97■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC54.97■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC54.97■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC54.96■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC54.96■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC54.96■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC54.96■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC54.95■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.95■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC54.94■■■■■ 6.39
NISCHQ9Y2I1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC54.92■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC54.9■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC54.88■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC54.88■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC54.88■■■■■ 6.38
NISCHQ9Y2I1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC54.87■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.87■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.87■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.87■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC54.86■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.83■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.82■■■■■ 6.37
NISCHQ9Y2I1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.82■■■■■ 6.37
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