Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR6Q9Y2C9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR6Q9Y2C9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR6Q9Y2C9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms