Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CFDP1Q9UEE9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CFDP1Q9UEE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CFDP1Q9UEE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFDP1Q9UEE9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms