Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDP2Q9P2J9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDP2Q9P2J9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDP2Q9P2J9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms