Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD8Q9NX08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD8Q9NX08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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