Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SAMSN1Q9NSI8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SAMSN1Q9NSI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms