Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms