Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THSD1Q9NS62 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THSD1Q9NS62 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THSD1Q9NS62 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms