Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC22Q9HCG8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC22Q9HCG8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms