Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2DQ9H6A0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DENND2DQ9H6A0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND2DQ9H6A0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms