Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39BQ9GZU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMEM39BQ9GZU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM39BQ9GZU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms