Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNM3Q9BZ71 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms