Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL25A1Q9BXS0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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