Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3CQ99613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3CQ99613 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms