Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDF2Q99470 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDF2Q99470 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDF2Q99470 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms