Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HAPLN3Q96S86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HAPLN3Q96S86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HAPLN3Q96S86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms