Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUDCD1Q96RS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCD1Q96RS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCD1Q96RS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms