Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF558Q96NG5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF558Q96NG5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms