Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX27Q96GQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX27Q96GQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms