Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VMP1Q96GC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VMP1Q96GC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VMP1Q96GC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VMP1Q96GC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMP1Q96GC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VMP1Q96GC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms