Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX1Q92499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms