Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms