Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFT2D1Q8WV19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFT2D1Q8WV19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SFT2D1Q8WV19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms