Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC82Q8N4S0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC82Q8N4S0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms