Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTROBQ8N137 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNTROBQ8N137 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTROBQ8N137 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTROBQ8N137 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTROBQ8N137 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms