Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM139Q8IV31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM139Q8IV31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms