Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NLRP13Q86W25 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NLRP13Q86W25 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP13Q86W25 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms