Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREML4Q6UXN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREML4Q6UXN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREML4Q6UXN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREML4Q6UXN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TREML4Q6UXN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms