Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF613Q6PF04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF613Q6PF04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF613Q6PF04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms