Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMF1Q6P1K2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMF1Q6P1K2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMF1Q6P1K2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms