Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EFCAB2Q5VUJ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EFCAB2Q5VUJ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
EFCAB2Q5VUJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms