Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C12orf60Q5U649 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C12orf60Q5U649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C12orf60Q5U649 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms