Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM23BQ5SRD1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms