Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC93Q567U6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC93Q567U6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms