Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL24A1Q17RW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
COL24A1Q17RW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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COL24A1Q17RW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL24A1Q17RW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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