Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN3Q16667 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKN3Q16667 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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