Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC6Q16204 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC6Q16204 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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