Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 GUSB-208ENST00000465785 625 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 48.3
SF3B4Q15427 GUSB-207ENST00000462371 820 ntTSL 312.55□□□□□ -0.42e-12■■■■■ 48.3
SF3B4Q15427 GUSB-214ENST00000489482 519 ntTSL 212.12□□□□□ -0.472e-12■■■■■ 48.3
SF3B4Q15427 GUSB-210ENST00000475316 505 ntTSL 38.34□□□□□ -1.072e-12■■■■■ 48.3
SF3B4Q15427 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 514.09□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 217.61■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.87e-11■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.367e-11■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.467e-11■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.537e-11■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 48.2
SF3B4Q15427 RENBP-208ENST00000464227 424 ntTSL 511.03□□□□□ -0.648e-9■■■■■ 48.1
SF3B4Q15427 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 213.23□□□□□ -0.297e-22■■■■■ 48.1
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SF3B4Q15427 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 48
SF3B4Q15427 SPHK1-206ENST00000590379 588 ntTSL 319.06■□□□□ 0.649e-9■■■■■ 48
SF3B4Q15427 SPHK1-208ENST00000591651 541 ntTSL 418.93■□□□□ 0.624e-9■■■■■ 48
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SF3B4Q15427 MAGED2-208ENST00000463787 662 ntTSL 37.32□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 48
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SF3B4Q15427 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-14■■■■■ 48
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SF3B4Q15427 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.239e-9■■■■■ 47.9
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SF3B4Q15427 DAGLB-206ENST00000462934 2589 ntTSL 212.72□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.196e-20■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.546e-20■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 24.6□□□□□ -1.676e-20■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.08□□□□□ -0.165e-23■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.699e-29■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-10■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.379e-29■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.369e-29■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 517.25■□□□□ 0.359e-29■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 217.22■□□□□ 0.359e-29■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-10■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-10■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 BANP-218ENST00000481948 1730 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 BANP-224ENST00000565242 801 ntTSL 311.05□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 47.8
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