Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKD1Q15139 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKD1Q15139 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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