Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL19A1Q14993 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL19A1Q14993 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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