Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX2Q13950 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX2Q13950 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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