Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNTB2Q13425 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTB2Q13425 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTB2Q13425 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms