Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC9Q06265 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms