Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNEQ04844 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNEQ04844 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNEQ04844 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms