Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APBA1Q02410 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms