Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX1Q01196 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms