Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCE1P61221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCE1P61221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms